
Muito pretendido, acabou na Luz ás ordens de Trappatoni, não sem antes participar na aventura portuguesa no Campeonato da Europa de Sub-21, onde portugal conseguiu o 3º lugar e consequente apuramento para os Jogos Olimpicos.
Antes de assinar revelou os seus sonhos, "Jogar num grande, ser campeão e chegar ao mais alto nível do futebol português", cumpriu dois deles.
O Benfica viria a ser campeão, Carlitos só jogaria por 10 ocasiões no campeonato, sendo apenas uma dessas vezes como titular logo á 2ª jornada frente ao Moreirense. Uma lesão num joelho num jogo da Taça Uefa, afastou-o dos relvados cerca de um mês, o que foi o principio do fim da sua aventura no Benfica.
Só voltaria a jogar em Dezembro, numa derrota pesada do Benfica em Belém por 4-1. Carlitos participaria ao longo do campeonato em quatro das sete derrotas benfiquistas nesse campeonato.
Terminada a época o futuro de Carlitos passou a ser discutido e a sua permanência na equipa não estava de todo assegurada. Com a chegada de Koeman, foi muito utilizado nos jogos da pré - época 2005/06, e foi a surpresa da 3ª jornada ao ser titular na visita do Benfica a Alvalade (1-2). Foi o seu único jogo oficial pelo Benfica nessa temporada.
Emprestado ao Setúbal, fez um excelente final de época, com golos decisivos e presença na final da taça pelo Setúbal. O Benfica não se impressionou e no final da época voltou a emprestá-lo para o Sion.
Na Suiça, transformou-se em figura do campeonato, excelente primeira época, levou ao interesse do Basileia que o contratou em definitivo na época 2007/08 e onde tem sido grande figura da equipa ao longo dos últimos anos, com vitória no campeonato e taça da suiça, além de boas prestações na Liga dos Campeões.